反叛大逆不道的人，都免罪不究。所有一切官员，都要勤勉谨慎对待自己的职事，顺应时节，敬顺苍天，使亿万人民都过安乐的生活。”三月，明帝临辟雍，第一次举行大射之礼。秋九月，沛王刘辅、楚王刘英、济南王刘康、淮阳王刘延、东海王刘政来朝拜。冬十月初五，明帝到辟雍，第一次举行养老礼。下诏说：“光武皇帝建明堂、辟雍、灵台三朝之礼，而没有来得及赏赐宴请长老耆宿。渺小的我，继承王位。趁暮春三月良辰，初行大射之礼，美好的十月元日，再到辟雍。尊事三老，兄事五更，安车软轮，亲执绥绶。侯王设醢浆，公卿设馔珍，我亲自袒袖割俎，拿着酒杯，给老者漱口。怕老人哽噎，前后捶背。升歌《鹿鸣》，下管《新宫》，八佾具列，万舞于庭。我深知自己德薄，怎么敢当？《易》说小人而服君子之器则致盗，《诗》也讽刺那非法制用器服的人，永远感到惭疚，内心牢牢记住。三老李躬，年高学明。五更桓荣，为我讲授《尚书》。《诗经》上说：无德不报，无言不酬。’今赐桓荣关内侯爵位，食邑五千户。三老、五更都以二千石俸禄养老终身。今赐天下三老，每人酒一石，肉四十斤，官员们要问候抚慰耆耋老人，怜恤幼小的孤儿，加惠于鳏寡，这样才符合我的心意。”中山王刘焉开始到自己的封地。十七日，明帝西巡视察，到长安，祭祀高帝庙及十一陵。遍览客舍，召集郡县官员，慰劳犒赏作乐。十一月初七，派使者以猪羊二牲祭祀萧何、霍光。明帝参谒陵园，对墓致敬。行进到河东，对所经过地方二千石县令、县长以下至于掾史分别赏赐。二十六日，明帝回到洛阳。十二月，护羌校尉窦林下狱死。这年，首次迎气于五郊之兆。少府阴就的儿子阴丰杀其妻郦邑公主，阴就因此自杀。

三年(60)春正月十七日，明帝诏令说“：我奉行郊祀，登灵台，召见掌天文的太史，放正天文仪器。春天，是一年的开始，起头得其正，春、夏、秋三时就有收成。近来，大水天旱不时发生，边境民众少食，上面的政事不当，老百姓就遭殃，一切官员应勤勉顺应时节，劝导督促农桑，消灭虫害；判刑处罚，要仔细谨慎，不要偏听偏信，白天黑夜一点不要怠惰，以称我心愿。”二月初九，太尉赵熹、司徒李讠斤免职。十一日，任左冯翊郭丹为司徒。十四日，南阳太守虞延为太尉。十九日，立贵人马氏为皇后，皇子刘火旦为皇太子。赏赐天下男子爵位，每人二级；三老、孝悌、力田每人三级；无户口的流狼人想自归首的，每人一级；鳏、寡、孤、独、患绝症，穷得无法生存的，每人发粟五斛。夏四月十七日，封皇子刘建为千乘王，刘羡为广平王。六月二十四日，有彗星出现于天船星北。秋八月二十五日，改大乐为大予乐。二十九日，日蚀。明帝下诏说：“我继承祖业没有善政。日月迫近相食，彗星见天，水旱不时发生，粮食歉收，人民没有隔夜的余粮，下面忧愁聚积。我虽日夜勤思，但智能不够。以前楚庄王时天地无灾，戒慎恐惧，求过于天。鲁哀公祸大，天不降谴。现在的异动怪变，还望可以挽救。全体官员努力搞好本职工作，匡救我的无德，古代公卿士庶献诗讽喻，师出箴言百士劝谏。群臣有议论批评的事情要说，不要忌讳。”冬十月，冬祭光武庙，开始献《文始》、《五行》、《武德》之舞。二十二日，明帝从皇太后到章陵，察看旧日的住宅。十二月二十七日，从章陵回洛阳。这年，修建北宫及各官府。京师及郡国发了七次大水。

四年(61)春二月十一日，明帝诏令说“：我亲耕藉田中，告祀先农，希望农事丰收。京师冬天没有大雪，春天不暖和滋，烦劳各部门官员，积储祷告。幸而近来又得及时雨，麦田润泽，现赏赐公卿半俸。所有官员勉力搞好时政，务必刑罚公。”秋九月十二日，千乘王刘建去世。冬十月十九日，司徒郭丹、司空冯鲂被免职。二十日，任河南尹范迁为司徒，太仆伏恭为空。十二月，陵乡侯梁松下狱死。

五年(62)春二月十六日，骠骑将军东平王刘苍罢免归藩；琅笽王刘京进入封地。冬十月，明帝到邺县，与赵王刘栩在邺县会见。常山三老对明帝说“：帝在元氏诞生，请求对这里有所优待，减免赋税。”明帝下诏说：“丰、沛、济阳，是祖先命创立帝业的地方，加恩报德，是很合适的。现在永平的政事，百姓不满，官员要求免赋，令人愧笑。难违此县三老的殷勤诚意，现免除元氏县田租更赋六年，分别赏赐县掾史及门阑走卒。”明帝自邺还洛阳。十一月，北匈奴入寇五原，十二月入寇云中，南单于把他们打退。这年，边境民众在内地郡县的都遣散回去，赏赐治装费每人二万。