去，派嗣延王到克用处催促他来护驾。皇帝到达渭北，韩建坚持要皇帝到华州。克用对延王说“：祸患始于当初当断不断，实在是皇上自己招来的。”李存信攻魏，葛从周领兵三万来救，战于洹水上。汴州人夜里在野外挖许多深坎，引克用军追击，克用之子落落连马跌入坎中，克用来救，马也陷落。追兵赶来，克用射杀汴将乃得脱身。存信已迫近魏城，克用与之合力。罗弘信派捉生迎战，败。克用追及外城，破城后回。于是，陕州王珙攻河中，李嗣昭援王珂，二战二胜，王珙之围解。

皇帝派延王持节到太原，对克用说：“不用你的建议，致有今日之难。现在我寄居华州，百司群官没一个可信托的。

除了你，谁还能与我分忧？否则，我再也见不到宗庙了。”王到太原，克用留王一个多月。每次宴饮，王都向克用敬酒，陈述国事，涕泪涟涟，希望能感动克用。那时刘仁恭盘踞幽州，对克用离心，克用几次召用他的兵都不应允。克用写信责备他，仁恭将信丢在地下，完全背弃克用。

因此克用添了幽州之患，只得好言辞谢延王，不再有西去之意。不久，克用带兵屯驻蔚州，恰逢大雾迷漫。刘仁恭来逼战，克用大败，退走太原，大将很多战死。

朱全忠夺得邢、磁、氵名三州，茂贞估计克用伤了元气不可能出师。于是与韩建假意与克用修好，写信给他。说皇帝在外多年，要克用共同修建宫室迎回天子。当初，皇帝避难石门，宫殿遭焚毁，及至岐人李茂贞再次叛逆，连闾里市肆都遭焚毁。宫城自黄昏至夜杳无人迹，只有狐狸哀鸣。皇帝到华州西溪，远望旧京方向，必泫然泪下，左右亦凄怆哽咽。此时王建正窃据两川，茂贞欲控制王建，无暇东顾。朱全忠则修缮洛阳宫室。茂贞约克用共同出力，克用不能推卸，出资助修建。

光化初年(898)，皇帝回到京师，诏克用与全忠和解。宰相徐彦若、崔胤也都劝解。克用虽然威势已折，但仍以自己功高位在全忠之上，不肯先低头。那时王。。与汴州全忠已言和，克用送信给王。。，让他代自己表达意思。全忠即派使者送信及礼品，十分恭敬，克用也同样答礼。然而全忠军日益猖狂，争战不已。

王珙请汴兵攻河中，克用派李嗣昭、张汉瑜援河中，汴兵退。葛从周取承天军，氏叔琮取辽州、东平，进驻榆次。克用派周德威将他赶走。李嗣昭率三万人马下太行，攻河内，拔怀州，进攻河阳。汴军阎宝来救，嗣昭退兵守怀州。天复元年(901)，朱全忠攻取晋州、绛州，逼迫河中。王珂告急，然汴军扼制道路，晋兵不得来。于是王珂被虏，珂妻是克用之女，也不能救。朱全忠乃据有河中，克用朝见贡献之路被阻。

全忠知克用窘困不振，乃大举攻太原，分派锐将氏叔琮等率领魏博、兖郓、邢氵名、义武、晋绛之兵围攻，晋城邑大都被攻克。遇天大雨，汴兵缺粮，士兵又传染疾病，乃解围。克用虽心中郁愤，但觉全忠强盛难与争胜，于是送重礼，请修好。全忠乃攻取同州、华州，屯兵渭上。

皇帝避到凤翔，李茂贞、韩全诲请皇帝召克用入宫护卫，克用派使者从小路奔回。

并写信给全忠，劝他回汴州，全忠不答。

克用率兵前往平阳，攻吉上堡，在晋州攻破汴军。李嗣昭、周德威攻下慈州、隰州，进驻河中。汴将朱友宁以十万兵驻军晋州南，全忠自己屯驻晋州。晋州人听说全忠兵来都大惊失色。那时有虹贯穿德威军营，氏叔琮逼近城堡猛攻，晋兵大败，兵械辎重全都丢失。朱友宁长驱攻取汾、慈、隰三州。进而围困太原，攻西门。德威、嗣昭沿山边带领余众归来，克用惊恐，带领士兵筑工事拒守。暗中与嗣昭、德威商议打算投奔云州。李存信说“：不如去倚靠北蕃。”国昌妻刘氏对克用说：“听说王准备弃城入蕃，是真的吗？谁出的主意？”克用答“：存信等建议。”刘氏说：“他是个牧羊奴，怎会有深谋远虑。王常笑王行瑜轻易弃城，终致身死。你为何蹈他覆辙？况且王前居鞑靼，几乎送命。现在一旦出城，祸患接踵即来，还能到达塞外么？”克用醒悟，弃城计作罢。几天后，走散的士兵渐渐回来。

嗣昭夜晚去偷袭友宁营，汴人惊恐，退走。德威追敌，到达白壁关，再收复慈、隰、汾三州。天复三年(903)，克用攻晋州。听说皇帝从凤翔回京师，乃退去。

云州都将王敬晖杀刺史刘再立，将地送刘仁恭，李嗣昭讨伐王敬晖，仁恭援助敬晖，嗣昭驻扎乐安。正准备出战，仁恭与敬晖弃城去。

皇帝东迁洛阳，诏书到太原。克用流泪对下属说“：皇上再也不会回来了。”