烟答都作为内应被投入监狱，失拜烟答遭捶打而死。等该事件平定以后，写亦虎仙被戴上枷锁押赴京城，交给刑部监狱，他的儿子仍关在甘州。失拜烟答的儿子马黑麻，在当地是米儿，他是写亦虎仙的侄女婿，因向朝廷献贡便暂时留在京城。探知王琼想扳倒彭泽，便突然闯进长安门诉讼他的父亲有冤，把彭泽投进了锦衣卫的监狱里。此时兵部和法司请求朝廷传布甘肃来的讯报，王琼想借此构成一个大狱，便上奏请朝廷派遣科道中的两个人前去核实。第二年，审核报告送到朝廷，没有证明彭泽有罪。王琼很愤怒，便弹劾彭泽欺罔朝廷使国家受到损辱，将彭泽贬斥为普通百姓。李昆、陈九畴被认为犯有激变土鲁番人的罪行，遭逮捕后交给法官审理，并遭深重的谴责。又过了一年，写亦虎仙被减免死罪，他便攀附钱宁，和他女婿一起得以服侍在皇帝的左右。皇帝喜欢他们，赐给他们国姓，授予他们锦衣指挥的官衔，让他们侍候皇帝南征。

满速儿自侵犯边关以后，屡次请求向朝廷通贡，朝廷不答应。十五年(1520)，满速儿将先前所劫掠去的将领和士兵以及忠顺王的家属全部归还过来，并且又请求向朝廷献贡。朝廷大臣讨论后决定答应他的请求，而忠顺王最终没有还回来。巡按御史潘仿极力上奏说不应答应满速儿的请求，而皇帝不听。第二年，世宗接皇帝位，杨廷和认为写亦虎仙熟悉中国的实情，放他回去必然成为边境的大患，便在正德皇帝的遗诏中书数了他的罪行。世宗皇帝便将写亦虎仙和他的儿子、女婿一起诛杀了，并起用陈九畴担任甘肃巡抚。

此时满速儿连年来向朝廷献贡，朝廷仍像以前那样礼待他们，亦不过问忠顺王的事。嘉靖三年(1524)秋天，满速儿率二万骑兵包围肃州，又分兵侵犯甘州。陈九畴和总兵官姜。。等人经过力战打败了入侵的贼人，斩杀了他只丁，贼人才退走。此事上报到朝廷时，皇帝命令兵部尚书金献民率兵西征，到达兰州时，因贼人已经退走很久了，便带兵回到京城。陈九畴借机极力陈说贼人不能招抚，请求朝廷封闭关隘，断绝通贡，一心巩固边防，皇帝同意。第二年秋天，贼人又侵犯肃州，分兵将参将云冒包围起来，以大队兵力进抵南山。此时陈九畴已经解职，其他的将领率援兵赶来，贼人才开始逃走。

当此之时，番人屡次侵犯边关城市，有关官员没有能力振奋国威，替边疆报仇雪耻，有几个新上任的官员反而借此构怨积愤。于是，封疆的大狱由此而兴。百户王邦奇，对杨廷和、彭泽素有仇恨，便于六年(1527)春上书说：“现今哈密国已经丧失，番贼侵略到内地，都是因为彭泽贿赂番人以求和和杨廷和治写亦虎仙的罪并杀死他而造成的。将此二人诛杀掉，哈密国就可得到兴复，边境地区就会安宁无事。”桂萼、张璁等也想借此事大兴牢狱，便把杨廷和、彭泽贬斥为平民，把他们自己的子弟、亲戚、党徒安排做狱官，致使有些人自杀身亡。他们又派给事和锦衣官前去哈密巡按。番族首领牙兰说并不是想得罪明朝廷，之所以侵犯边境，是由于朝廷冤枉杀死写亦虎仙和失拜烟答两个人的缘故。现在愿意将哈密城的官印交还出来以赎前番侵犯边境之罪。此事皇帝交给兵部处理，尚书王时中等人说“：番族首领请求向朝廷献贡已有四次之多，先前已经交给总制尚书王宪处理，王宪让其贡使回去转达朝廷的谴责之意。现在牙兰的请求应当不会是虚妄的。考虑到这些话是从牙兰嘴里出来的，大概不是想真正向朝廷献贡，而是欺骗我们以求得和平。如果他果真有悔罪之意，一定会先将哈密城的印和所掳掠的人畜交还回来，把首恶分子戴上枷锁送过来，然后在嘉峪关门口向朝廷大臣稽首，才能答应他们的请求。”皇帝采纳了这个建议。桂萼因前次的大狱没有兴成，想重兴大狱，便请求朝廷留下牙兰的人质，再派遣译者去谕告牙兰，让他归还所侵之地。同时，桂萼等人又与礼部、兵部的尚书方献夫、王时中等人协商，向皇帝呈上带有挑拨性的言词，说番族人向朝廷上书已有四辈，他们都将罪责推诿在前任官员身上，虽然他们的言语多是诋毁矫饰之词，但事出亦必有原因。朝廷应派官员对前任官员有无激变番族人之事严加核查，以使番族人心服，至于其他方面可按上次的提议办。陈九畴当初向朝廷报捷时，声称满速儿、牙兰二人都已死在炮石之下，而实际上二人并未死。皇帝本来对此就怀疑过陈九畴，现在看了桂萼等人的提议之后，更加怀疑边防大臣欺罔朝廷，于是手书诏书数百字，严厉责备陈九畴，想置他于死地，同时告诫首辅杨一清不要庇护陈九畴，于是派官将陈九畴逮捕起来。尚书金献民、侍郎李昆以下的四十多人都因此受牵连。

七年(1528)正月，陈九畴被逮到京城投入监狱，桂萼等人一定要杀他，并株连杨廷和和彭泽。刑部尚书胡世宁奋力挽救，皇帝稍有醒悟，免除了陈九畴的死罪，发配去守边疆，彭泽、金献民等人都被削夺了官职。这样一来，番族首领气焰更为嚣张、骄横，而桂萼又举荐王琼监督三边事务，将陈九畴所拘留的番族使者全部释放回去，并允许他们向朝廷通贡。番族首领却并不悔改自己的罪过，仍像以前一样侮辱和玩弄中国。这时因牙兰得罪了其主人，便率领自己的部下来归附朝廷，边防大臣接纳了他。满速儿为此很愤怒，其部下虎力纳咱儿勾引瓦剌的二千多骑兵侵犯肃州，到老鹳堡时，正好撒马儿罕的献贡使者在该堡中，贼人便呼叫该使者，与他讲话。游击彭浚急忙带兵袭击贼军。贼人声称自己是想问信通和的，彭浚不理，进兵战斗，打败了贼军。贼人逃到赤斤，派人持番族文书前来求贡，并将罪过推诿到瓦剌头上，其言词颇多狂忤谩骂之句。王琼抓住这个机会，一心想招抚他们，便上书给朝廷说番族人已经悔悟自己的罪过，应该原谅他们并赦免他们的罪行，以便我们停止战争使百姓得到休息，同时为彭浚和副使赵载请功。他的这个奏章被皇帝转到兵部。