张伟待和约签订，留下左良玉校尉领两千神策军将士镇守长崎，又在临行时大募日本民伕，将原本的长崎城翻建改护了三倍有余，留下四十门放于新筑的长崎城，待左良玉送张伟至码之际，张伟待：“若倭人反复，不必击，倚城利炮而守，控制住长崎，我便能及时来援，也方便登陆。切不可贪功而，切记切记。”

说罢飘然而去，自乘船回台北去也。此番征日所获良多，数万大军经过这场大战，不但是新兵经历战火洗礼而迅速成长起来，便是那打过台南的老兵，亦是受益良多。张伟又命随行参军记下战役中的得失，汇编成教材，所有的伍长果尉，以及台北讲武堂的学员每人一本。这实战中记录的战术教材，可比一百次演习都有用，张伟自然不会放过这个提队战斗力的机会。除此之外，又下令将战斗中表现良好的伍长、果尉征讲武堂，一面学习更的战役理论，一面以战术教官的份向学生讲解战术。再过两年，这些首批讲武堂的学毕业，便可直接以果尉职充实军队，这些经历过系统的文化知识教育、军纪军规教育、火科学教育，以及系统战役战术训练过的学一旦加军队，整个台湾三卫军的实力，必将大步跨越几个台阶。

回台后半月不到，师便护送着百余艘运输船自长崎而回，只是此番到不是运送兵员，而是满载了整船的白银及粮而回，船队一回，便象征着整个伐日之战的彻底终结。

除去应有费，自日本得银仍有半数被封存在台北政务署的库房，这笔钱张伟有言在先，任何使费皆不得动用，全数拨给台北船厂造舰。征服日本后下一步自然是要剑指南洋，而南洋之战，海军的作用却又比陆军重要的多，没有一支大到与列周旋的海军，称霸南洋自然也无从谈起。何斌调集了工商财务署下所有积年的算账好手，将造船的成本、火炮、每船所需手费用都算其中，算来如同镇远级大舰可造八艘，每船十二磅炮四门，八磅炮十二门的小型炮船十五艘，加之原本就购买建造的远字级大艘八艘，小型炮船二十二艘，计有大型战疆六艘，小型炮船三十七艘，海军军官手，以及岸上辅助人员，一共一万两千人。这样的海军实力，已经远远超过当时除荷兰外的任何一个欧洲国家在亚洲的驻防舰队。

接下来左右不过是犒赏三军，除了猪羊上好酒外，每人二十两银的犒赏足足令大半的三卫士兵笑的腮帮疼。张伟这番大手大脚的犒赏，足足费了台湾政务署七十余万白银，若非是日本赔款送来，还当真是支付不起。何斌少不得要埋怨几句，张伟也只笑笑便罢了。那清朝时八旗绿营征，比如征小金川一战，几年时间了白银三千万两，动员军队也不超过十万人，银怎么用的，不过是买粮雇工，以及打了胜仗的赏银。是以清朝外战不行，内战却是近两百六十年甚少打败，何也？清朝统治者舍得钱在军费上，不象崇祯皇帝，连军饷都要士兵自已想法，两相对比，张伟自然知钱要在何方是合算。

待预算好，便帘拨银至船厂，买木料、雇佣人

至于藩主自已的军队，我们到还没有放在里。”

为难之事已经解决，九州不驻兵不过是此许小事，日方自然连忙答应不迭，双方又商讨了支付割的细节，两日之后，于江将军府内，中日双方正式缔结了《长崎和约》，结束了因日方驱逐张伟使者引发的这场贸易战争。

见左良玉唯唯诺诺连声答应，又：“我此番回去，会派行政官员过来接此地。驻军要合他们，不可以枪杆在手便轻忽文官，我若知你有违令或是纵容属下败坏军纪，定斩你不饶！”