一项利工程或许可以这样加行，政治工程可就没有那么简单。现在看来，海瑞当时的置可能是简单了。他受理的案件如此之多，事实上也不可能不简单。可是他涉及到的问题，却又十分复杂：丈量土地，清退农田，平反冤狱，整顿治安，兴修利，遣散募兵，刷新吏治，考官员，以及推行“一条鞭法” (一新的赋税制度)等，哪一件不是盘错节，牵一发而动全？然而海瑞的力量却很单薄，既没有明确的法律条款，又没有得力的专门机构，仅凭一政治情，外加对善与恶的德直觉，就希望快刀斩麻，在一个早上把百年积弊清除殆尽，其不能成功也自不待言。

这样一工作情也是海瑞所独有的。他本来就是工作狂，下车伊始，又发现要的事千万绪，真可谓百废待兴。海瑞知，像他这样既非士又没有后台老板的人，能官任封疆，是特例中的特例，唯有拼命工作，才能报答国家，不负皇恩。何况，这时他已经五十好几，能事的时间已不太多，亦所谓“时乎不待”因此他有一迫，很有些韩愈当年“为圣朝除弊事，肯将衰朽惜残年”的味。另外，他心里也有数：天下没有不散的宴席，也没有不下台的官，他海瑞就更是如此，只能在任一天就猛一天，能多少事就多少事，为了加快吴淞江治工程的度，他把行署设在工地，并斩杀了三个监工不力的吏员，把他们的尸用席卷起埋在行署厅前。结果，工程展迅速异常。一个本想阻拦、陷害海瑞的巡御史还没来得及下手，工程便已完成，那个巡也只好徒唤奈何，叹息说“万世功被他成了”当然海瑞也让人挖了厅前的尸，却是三只猪，而那三个吏员则被海瑞转移藏匿在别。

功”然而海瑞似乎并不懂得“一张一弛，文武之也”的理，他的工作情不但没有稍减，反因初战告捷而倍增。他不满足于坐在巡抚衙门接受投诉(前面提到，这投诉已达每月七八千件之多)，还要亲临府县听取诉讼，一一过问，一一审理，一发而不可收拾，斗争的弦也就越绷越。

海瑞以作则，力图以德来清除积弊，结果怨声四起；张居正锐意革新，力图用法令来振作神，结果抗拒横生；申时行妥协安抚，力图用调和来维持团结，结果众叛亲离。他们都失败了，正所谓“可怜无补费神”显然，他们这个帝国，其实已无药可救。

对海瑞的弹劾几乎与海瑞在应天的改革同步行，而且同样手极重，攻势凌厉。给事中凤翔甚至危言耸听地说，在海瑞的治下，佃不敢向业主缴租，借方不敢向贷方还债，民间传的说法是“田不如告瘦状”如果不是因为海瑞自己清廉到无可挑剔，他一定会被描述成周兴、来俊臣那样的酷吏。内阁也为海瑞的法忧虑。他们想起一个医生，这个医生曾给病人猛吃豆，还振振有辞地讲什么医书上说“豆不可轻用”当然要重用了。内阁觉得海瑞就是这样一个医生，应该迅速地将其从巡抚的任上召回，以免我们这个原本就病病歪歪的帝国被他过度的情医得人仰翻。