业人口、社会底层人员、平民百姓纷纷走上街头，愤怒的要求压榨他们生存资源来作为军费、搞特种研究妄想恢复以前军国时代的政府给他们一个说法，并且赔偿他们的损失。

紧跟着日本政府进行违禁研究的事情曝光，活体实验、生化实验、克隆实验、生物武器的研究这些被不知名组织散布出来的资料证据让日本政府百口莫辩，政权和天皇的地位在民众的愤怒中摇摇欲坠，恼羞成怒的日本政府不理来自外界的威胁，竟然疯狂的对国内的反对势力进行了武力镇压。

这个时候，一个代表着民间反对力量的组织浮出了水面“新大和民族组织”成为了那些反对人群的依靠对象，拥有奇怪能力抵抗政府武力压制力量的“新大和组织”成为了政府主要打击的目标，同时具有特能能力的人类也第一次公开出现在世界人民的眼中。

“新大和组织”的领袖据说是日本具有几百年历史的忍者流派“叶隐流”和“服部流”受到镇压的普通民众出于对日本历史上传奇的存在“忍者”的崇拜，坚信这些“叶隐流”和“服部流”的神奇忍者是来带领他们建立新政权的英勇武士，纷纷加入了“新大和组织”成为了一股足以和政府对抗的地下势力。

“新大和组织”叶隐流忍族的新任总长对一直以来日本平民所恐惧的黑道势力格外残忍血腥，短短时间内，不论是和政府有所牵连挂钩的社团，还是普通的民间势力，只要是被“新大和组织”盯上的黑道组织都会被毫无婉转的血腥清洗，手段之残忍，意念之坚决令所有黑道上的人物胆寒。

日本平民被黑道组织迫害的历史远追古时，常年已经习惯了黑道存在和压迫的日本人们对这些敢怒不敢言的邪恶分子爆发出了最大的愤慨，日本在近期的混乱中，不但失去了大半可以依仗的特能者，还暴露出违反国际公约的秘密实验，现在国内又爆发了大面积的反政府活动，已经成了千夫所指的对象。

可是被逼到墙根的日本掌权势力，不但不考虑化解这些矛盾，反而不知悔改的狗急跳墙起来，政府眷养的特能者组织樱花社也出现在了与反政府组织的对抗中，同时大批黑道势力人员被政府强行征召进入新成立的“天照部队”已经被“新大和组织”剿杀的走投无路的黑道势力人员们为了活命，义无反顾的成为了“天照部队”的试验品，短时间内大批的基因战士出现在了和“新大和组织”对抗的战斗中，大批的“新大和组织”成员被这些打不死砸不碎的怪物士兵俘虏，成为了新的“天照部队”预备役。

仿佛噩梦般的怪物出现，让整个世界的人们陷入了恐慌，世界末日的预言传说越演越盛，本就紧张的国际局势越发的气息凝重起来，针对日本的声讨和抗议仿佛成为了联合国每天例行的饭菜，可是掌握了所谓“基因进化”的日本政府猖狂的不予置否，我行我素的进行着对日本国内叛乱的血腥镇压。