将国防部的错误命令直接发回国防部，并指出错误，同时抄送一份至东帅处。

军队的驻扎、调动方式也发生了变化，在各行省中，固定的“军”被取消，部队的最大常设单位为“师”而且其直接受到国防部的指挥，没有东帅和国防部的共同命令，总参谋部无法调动陆军和海军部队，其唯一能独自调动的只有两栖部队，而东帅则有超越国防部的权利，可以任意调动任何一支部队。

当得到国防部或者是东帅的命令后，总参谋部才可以调动部队，并且根据行动的性质，将零散的师整编到一起，或者编为军，或者直接编为集团军，任命军长、司令，指定参谋组成参谋部，并向目标地域开进。在这种时候，原来由国防部指挥的后勤部门则直接由总参谋部领导，并向其负责，提供一切后勤支援。

而边疆区的军事体制则与行省不一样，由于这里靠近国境线，不能有丝毫的松懈，因此，这里的军事体制由安全向效率倾斜。在这里，部队的最大常设单位可以是军，也可以是集团军，这由当地的总督决定。军的军长或者是集团军的司令由当地总督任命，但是，为了防止总督拥兵自重，这些部队的师长、旅长、团长和中下级军官以及部队的参谋人员由国防部直接任命，而且总督不能将其罢免，但部队主官要绝对服从总督的命令，除非总督命令自己向内地行省开进，或者其下达的命令违法，否则军队主官不能拒绝服从命令。更为重要的手段是，每隔三年时间，国防部将把边疆区的部分部队进行换防，或者与别的边疆区对调，或者与内地部队对调，总之，要既能保持当地部队的有效战斗力，也要能够有效防止藩镇出现。

另外，出于军事准备的需要，在地方预备役部队镇戍军中，开始试行义务兵役制，服役时间暂定为三年。

为了严肃军纪，军事检察院和军事法庭也正式永久设立，遇到现役军人犯罪的案子，地方法院不能审理，而由军事法庭进行审理，而且被告一旦被定罪，其只能向终审法院提起上诉。

第四个改革措施是关于各部部长的任命。部长的任命完全由东帅一人决定，无需通过常设国民大会的认可，任期为六年，但是，每过两年，常设国民大会便会对各部部长进行一次政绩考核，若其不称职，则可以自动发起弹劾程序，一旦弹劾通过，则由议长向东帅提出重新任命的建议，而东帅也必须另换人选，继续剩下的任期，但此人的上任就必须得到常设国民大会半数赞成票的支持，否则不被认可，而且将由常设国民大会自行选出一人担任此职，直到此届任期结束。

第五个改革措施为财政方面。由常设国民大会与财政部共同组成预算小组，试着进行国家财政预算的制订，但这个小组暂时没有财政决定权，其权利暂时仍旧掌握在东帅与财政部手中。

第六个改革措施为情报系统的改革。作为最为有效率的情报组织，青衫社继续完善本身的组织体系，而且其被分割为两个不相统属的部分，青衫左社改名为国家情报局，主管国内及国外情报收集和整理，并监视内部敌人。青衫右社改名为军事情报局，主管军事情报的收集与整理，并向国外发展情报人员。国家情报局隶属于财政部，其资金来源由财政部全权负责，而军事情报局则受到财政部与国防部的双重领导，资金来源于财政部，而人员与行动则由国防部属下的总参谋部指挥。