领水师。[7]（卷三二七）

同治二年正月，都兴阿奏称各帮师船亟应裁撤，而欠饷甚多，红单船船价、勇粮有欠至二十余月、三十余月者，既裁撤，必应补给，旧欠应由粮台造册，咨交两广总督补发，并先由江苏巡抚筹给一月口粮作为盘缠回粤。拟派参将李新明督同广东师船回粤。请派总兵陈国泰统带回粤。清廷准行。[7]（卷三三二）三月，护王陈坤书率部自天京七里洲北渡，被吴全美等所败。四月，李鸿章在给曾国藩的信中写道：“奉旨饬查大江水师一案…缘吴全美接统后江面渐觉肃静，郭定猷、张瀚等现仍分防，未便追究既往。陈国泰所部济贼多年，兹已遣撤回粤，应予薄惩。泊镇年老勒休，似亦可塞众望。江防吃重之时，无船可替，既用其人，不得不量从末减。且水师借口饷缺，营规实难深求。”[10]（卷三）五月，湘军水师陷九洑洲，守军2万人阵亡。八月，都兴阿、富明阿奏称：“总兵吴全美自军兴以来，久带水师，转战江南、江北，叠著战功，营规整肃，大小将弁，无不畏服…联络调度一切均合机宜。”[7]（卷三五）九月，曾国藩奏称：“本年三月，有人见黄彬在船宴客，闻即粤逆渠魁。五月内石埠桥甫经投诚之贼在仪征县杨钟琛公寓宴饮，门外拥进多人，询系黄彬水勇来寻贼目索取米账。并有接济贼米之船经民团查获，该镇辄借词抢案惩办民团。”[11]（卷一九）同治三年四月，清廷调都兴阿为西安将军，以富明阿为江宁将军。富明阿奏称：“江防各帮师船随征十余年，身经百余战，巡防堵截，力保完善…师船一律议裁，似与凯旋无异，可否由臣择尤请奖以示鼓励之处，出自鸿慈。”清廷命“著照所议办理”[7]（卷三七四）。五月，以吴全美为福建水师提督。六月，曾国荃攻陷天京，太平天国政权结束。七月，富明阿奏称：金陵克复，红单船二十五只，作为头批，令提督赖镇海管带回粤。二批派副将林宜华管带回粤。三批统由提督吴全美统带回粤。[7]（卷三八五）八月，富明阿奏称：吴全美禀：红单船自咸丰三四年间先后奉调出师，由粤而闽而江，十有余年，转战三省，兹幸金陵克复，各船遣散，官弁兵勇，共庆生还，而追念死事诸人，未忍听其湮没，拟捐资在广东顺德建立忠义祠，历年伤亡官兵均准入祀。清廷同意。[7]（卷三九○）十二月，清廷因徐宗干奏请，命福建水师提督吴全美迅速赴任。[7]（卷三九九）吴全美请假三个月回籍修墓。清廷准许。[7]（卷四○○）

同治四年四月，闽浙总督左宗棠命吴全美速带所雇红单船20艘、拖罾船20艘驶赴铜山，阻截侍王李世贤部出海。[7]（卷四○四）闰五月，李世贤部失败，左宗棠派吴全美部巡海。[12]（卷一四）五年五月，吴全美因病开缺。[12]（卷一七）光绪八年（1882年），吴全美督建鹅颈炮台，命名定洋。又修复沙角炮台，抵抗法国侵略。[5]（卷二八）吴病死于光绪十一年。综上所述，可见红单船是广东民间经营对外贸易的大货船，为了对付海盗的侵袭，装备有火力强大的枪炮。在太平天国时期，清政府雇佣这些船只，配备水师军官以镇压农民起义，经费由广东省筹措，基本上由各县绅士捐输。红单船武装先后在福建、江苏、安徽等省与农民起义军作战，击毁太平军船只以千计，杀伤太平军以万计，夺获军火、粮食等物资数量惊人，给太平天国带来了严重的伤害。由于其月饷不能及时供给，于是私设关卡，抽收厘金自给，进而与太平军贸易自肥。又抢劫商旅，杀害民众，虚报战功以求封赏。终于为人揭发，被陆续裁撤。红单船问题是太平天国史上很值得研究的课题。