为亲耕的礼可以废掉。我听说先王制定典章，皇帝亲耕农田的日子将到，司徒斋戒，司空扫除坛地。五天以前，有和风的应兆，王到斋宫，祭祀之后，启用农具，真是慎重极了。自癸巳以来，一直西北风，好雨不下，寒气不散。迎春东郊，既然没有亲去，为百姓作表彰，这是应当的，这样才可迎来和气，招引时风。

《易》说‘君子自强不息’，就是这个道理。”奏书送上，皇帝采纳了。不久，黄琼升尚书令。黄琼认为以前左雄上奏关于选举孝廉，专用儒学文吏的办法，对于选拔士人，尚有不足的地方。于是奏请增加孝悌及能从政者为四科，全部得到施行。又左雄前议选举官吏先在公府考试，端门复试，后来尚书张盛奏请废除。黄琼又上言“：复试这种办法，是为了澄洗清浊，核查虚伪和失实，不应当改革。”皇帝于是没有废除此科。调魏郡太守，稍迁太常。和平年间，选入宫中，为皇帝讲学。

元嘉元年(151)，升司空。桓帝想表扬大将军梁冀，使朝中二千石以上讨论表扬的礼仪。特进胡广、太常羊溥、司隶校尉祝恬，太中大夫边韶等，都称颂梁冀的功勋德行，认为表扬的礼仪赏赐，应比周公，赐给山川、土田、附庸。黄琼独建议说“：梁冀前因亲迎皇上的功劳，增邑三千，又对他儿子梁胤也增加了封赏。从前周公辅佐成王，制礼作乐，使天下太平，所以大辟土宇，开地七百。现在诸侯按户邑为制，不按里数计算。萧何在泗水结识了高祖，霍光挽救危亡了的局势，复兴国家，都是益户增封，以显扬他们的功业。梁冀可以比邓禹，宜食四县，赏赐可同霍光，使天下晓得赏一定要与功相当，爵位不要越超他的德行。”朝廷采纳了。梁冀怀恨在心。正值地震，诏令免了他司空的官，再任为太仆。

永兴元年(153)，升司徒，调太尉。梁冀前后托黄琼推举征召的，一个也没有任用。虽有好人而是梁冀所看得起推举的，也不任命。

延熹元年(158)，因日蚀被免职。不久，又被任命为大司农。第二年，梁冀被杀。太尉胡广、司徒韩缤、司空孙朗都因阿谀依附梁冀罢免，再任黄琼为太尉。因为是师傅，又不阿谀依附梁冀，封为亢阝乡侯，邑千户。黄琼以病辞让六、七次，言词恳切真挚，终于得到皇上的批准。梁冀既诛，黄琼在朝廷位居第一。检举州郡贪污至死的十多人，海内由是希望黄琼很快整顿朝纲。然而，不久就有五侯擅权，朝廷内外动乱，黄琼自己考虑无力量匡正，于是托病不工作。

延熹四年(161)，因寇贼骚扰，免职。这年再任为司空。秋天，因发生地震，免职。延熹七年(164)，黄琼病重，上疏劝谏说“：我听说天者务在刚其气，君者务在强其政。所以王者处高要自持，不可不安；履危要任力，不可不据。自持不安，就会跌倒，任力不据就危险。所以圣人升高据上，就要以德义为首，涉危蹈倾，就要以贤者为力。唐尧以德化为首，以稷、契为筋力。高而更高，动而更定，这就是从前圣王所以能长守万国，永保社稷的原因啊！从前汉高祖应天顺民，用武力称王，扫除秦朝、项羽的势力，革命创建国家，以德化施于后世。到了哀帝、平帝时，帝道不纲。政治一天一天地紊乱，使奸人谄媚之徒专政，外戚胡作乱为，不重仁义，不用贤佐，终于垮台，西汉灭亡。天柱倾颓，人民鬼神悲怆，幸皇天爱护，火德复辉。光武皇帝天生圣武，继承大统，复兴汉业。创立基业于危险之中，立足于艰难之际。于普通人中选拔贤者，在未有天下之形兆时，奖励有功之士。战争中还注重礼义，乱离之际，也遵循道德教化。这样，因而历高而不倾倒，任力危而不跌，复兴大业，开建中兴，光被八极，垂名无穷。到了中世，盛业慢慢衰微。皇上原在藩国，升登帝位，天下的人拭目盼望，说天下可见太平。但是即位以来，没有看到好的政治措施。梁冀一家大权独揽，宦官充满了朝廷。爵位一封再封，官职一升再升，倾乱朝廷，卿校牧守的选拔任用，都是他们的门生党羽，羽毛齿革，明珠南金等珍宝，堆满了他们的房室，富比王府，势回天地。说他们的，一定遭到灭族，依附他们的，一定升官发财。