四州诸军事、豫州刺史。任命散骑常侍郗昙为北中郎将、持节、都督徐兖青冀幽五州诸军事、徐兖二州刺史，镇守下邳。冬十月乙丑日，陈留王曹劢去世。十一月庚子，打雷。辛酉日，地震。十二月，北中郎将荀羡和慕容隽在山荏交战，荀羡大败。

三年春三月甲辰，下诏书，因为连年打仗，粮草运输跟不上，自王公以下每十三户借调一个人帮助运输一年。秋七月，平北将军高昌被慕容隽攻逼，从白马逃往荥阳。冬十月慕容隽侵犯东阿，朝廷派西中郎将谢万驻在下蔡，北中郎将郗昙驻在高平，攻打慕容隽，官军大败。十一月戊子日，进升杨州刺史王述为卫将军。十二月，又任命中军将军、琅邪王丕为骠骑将军，东海王奕为车骑将军。封武陵王晞子<王逢>为梁王。交州刺史温放之率领军队讨伐林邑参黎、耽潦，全都降服了他们。

四年春正月，仇池公杨俊去世，儿子杨世继承爵位。丙戌日，慕容隽死，儿子幕容暐继伪位。二月，凤皇带九个小凤凰出现在丰城。秋七月，因为频繁打仗和徭役，省减宫廷膳食。八月辛丑初一，日食，是全食。冬十月，天狗星落于西南。十一月，封太尉桓温为南郡公，弟弟桓冲为丰城县公，儿子桓济为临贺郡公。凤凰又出现在丰城，有众多的鸟跟随。

五年春正月戊戌，大赦，赏赐鳏寡孤独没有生活能力的人每人五斛米。北中郎将、都督徐兖青冀幽五州诸军事、徐兖二州刺史郗昙去世。二月，任命镇军将军范汪为都督徐兖青冀幽五州诸军事、安北将军、徐兖二州刺史。平南将军、广州刺史、阳夏侯滕含去世。夏四月，发大水。太尉桓温镇守宛城，派他弟弟桓豁率领部队攻取许昌。凤皇出现在沔北。五月丁巳，穆皇帝在显阳殿去世，当时十九岁。安葬在永平陵，庙号孝宗。

哀皇帝名司马丕，字千龄，成帝长子也。咸康八年封为琅邪王。永和元年援散骑常侍，十二年加授中军将军，升平三年除骠骑将军。

升平五年五月丁巳，穆帝去世。皇太后下令说：“穆帝突然患病不能治，继承人没有立，琅邪王司马丕，是中兴王室的正统，德性完美的宗亲。从前在咸康时应当作太子。因为年岁幼小，不足以承担国难，所以显宗成帝让位给康帝。现在亲情名望地位，没有能比得上他的，让琅邪王继承皇统。”于是百官准备好马车，到琅邪王的府第去迎接。庚申日，琅邪王即皇帝位，大赦天下。壬戌日，下诏说：“朕得以承受圣明之命，入朝接受皇位。想到先王宗庙，祭祀没有主人，太妃哭丧的宫庭，空旷没有可以安身之处，心中十分悲痛，五脏就像抽割一样痛楚。宗国所尊崇的，情和礼受到同样重视，子孙继嗣的重要，情与义没有不同。东海王司马奕，是亲近的戚属，应当敬承本族统绪，应以司马奕为琅邪王。”秋七月戊午，把穆皇帝安葬在永平陵。慕容恪攻陷野王，守将吕护退保荥阳。八月己卯日晚上，天空有裂缝，宽数丈，有雷一般的声音。九月戊申，立皇后王氏。穆帝皇后何氏称永安宫。吕护反叛，投奔了莫容暐。冬十月，安北将军范汪犯了罪，被废为庶人。十一月丙辰，下诏说：“显宗成皇帝顾命临终时留下遗命，因为时事多难，弘扬高世的风教，树立德义博得威重，用以振兴社稷。但是国难不断，康帝穆帝过早地离开人世，继续的国运不盛。朕以寡薄的德行，又继承先王的事业，心中有长久的思慕，悲痛摧折人心。昭穆两个皇帝的大义，原本应遵从上天。继承国家大业，是古今的常道。理应上继显宗，用以绵延本族统绪。”十二月，加凉州刺史张玄靓为大都督陇右诸军事、护羌校尉、西平公。