调动，连任五职，都没有正式拜授。当时高宗萧蚕想登上皇位，凡是诛杀封赏各种事情都衹和萧遥光一人共同商议。

建武元年，以萧遥光为持节、都督扬南徐二州诸军事、前将军、扬州刺史。晋安王萧宝义当时任亩徐州刺史，所以萧遥光请求解除都督南徐州军事的职务，得到允许。建武二年，萧逐光进号抚军将军，加封散骑常侍，并赐给带布幔的车和鼓吹乐一部。萧遥光喜欢判理诉讼之事，自认为公正严明，但被他残酷杀害的人很多。由于患有脚病，不能与百官同在朝廷站列，所以常常乘车从望贤门入宫。每次和明帝闲谈很久，谈完，明帝要香火敬神，第二天必定要杀人。明帝认为自己这一支脉近亲人少，势单力薄，对高帝、武帝的子孙既恨又怕，想把他们全都杀掉。萧遥光便帮他参谋策划，要依次施行，逐步除掉他们。永泰元年，萧遥光就任本位赠为大将军，赐给油络车。明帝患病，萧遥光多次入宫侍候，明帝病势逐渐沉重，河东王萧铉等七王在同一夜全被杀害，这是萧遥光的主意。

明帝驾崩，遣诏加封萧遥光为侍中、中书令，赐给扶侍一人。东昏侯永元元年，又赐给他带剑仪仗队二十人，即以大将军号开府仪同三司。萧遥光既已辅佐朝政，见东昏侯即皇帝位，暗中与江柘兄弟谋划要自立为帝。其弟萧遥欣在荆楚，拥有重兵居于长江上游，秘密地准备起兵响应。萧遥光当即据东府发出号令，要萧遥欣马上领兵火速束下.阴谋将要发动，但萧遥欣病死。江柘也被诛杀，东昏侯召萧遥光进殿，把江柘的罪行告诉了他，萧遥光很害怕，回到台省便假装发狂号哭，从此以后藉口有病不再进入朝廷。先前，萧遥光出行回来进入城中，风把仪伞吹起飘出了京城。

萧遥光弟萧遥昌先死于寿春，其豫州的部下都归属萧遥光统领；及萧遥欣归葬于武进，暂时停柩在束府前的小洲上，荆州来送葬的人很多。束昏侯诛杀江柘后，忧虑萧遥光自己不安心，想转调他为司徒回到府第，召他进宫告诉他这个意思。萧遥光担心被杀，于八月十二日黄昏，收集荆、豫二州的部属，在东府门前聚集了很多人，街上路人都觉得很奇怪，不知他们想干什么。萧遥光召见亲信丹阳丞刘涸以及很多卑贱之人，想以讨刘喧为名发难。并连夜派遣好几百人攻破束冶放出囚徒，到尚方署取来兵器。又召骁骑将军垣历生，垣历生跟随着使者立刻就到了，他劝萧遥光派他率领城内的兵马连夜攻击朝廷，用车载蒿草去焚烧城门。他说：“你衹需乘车跟在后面，反掌便可夺取台城。”萧遥光狐疑，不敢出动。天稍微有些亮，萧遥光便身穿军服出外听消息，停车安排仪仗，登上城楼施行赏赐。垣历生又劝他出兵，萧遥光不答应，却希望朝廷内部自己发生事变。

到中午，朝廷的军队渐渐到来，尚书给萧遥光的檄文中说：“逆顺的运数，是有明显征兆的，干犯纲纪扰乱常规，刑法是不会赦免这种人的。萧遥光是宗室的败类，品行卑劣才能浅薄，他像缇裙山的瘸子想上天，天路哪有他登的阶级。他从前就受到明帝的知遇，恩待他好像儿子一样，而且礼敬宠信超过了一般的皇子。赐给他的旗章车服等仪仗，超过了藩王的尊严；他所据府第宽阔，超过了城墙的规模。等到圣皇升天，他亲受顾命托孤的重任，先帝的话犹在耳，德音尚存，他就欺侮蔑视皇上，并不害怕背负不义的名声，他心中没有君父，像寒霜一样由来已久。甚至私下在京畿发兵，进犯朝廷，自古以来巨大的挑衅事件，没有哪次能比这次更过分。现在我命令六军，宣布对你讨伐。皇上当会亲驾兵车，实施这朝廷的重大的战略。指长江为誓，一定要奖赏勇士，惩罚你这逆贼。”于是全城戒严，在京城部分地区实行大赦。领军萧坦之屯兵湘宫寺，镇军司马曹虎驻扎在清溪大桥，太子右卫率左兴盛驻守束府束篱门。