第二年，朱玫就战败而死。

李茂贞因功从扈跸都头拜为武定军节度使，赐给他姓名。

护从皇帝车驾束归，到凤翔，凤翔节度使李昌符和天威都头杨守立争路，率兵相攻，李昌符没有取胜，逃到陇州。

唐僖宗派李茂贞击杀李昌符，因功拜为凤翔陇右节度使。

大顺元年，封为陇西郡王。

二年，枢密使杨复恭犯罪，逃奔到兴元，兴元节度使杨守亮，是杨复恭的养子，收留了他。

李茂贞于是上书说按杨复恭父子的罪行都应杀掉，于是自己请求任山南招讨使。

唐昭宗由于宦官的缘故，感到为难，没有答应。

李茂贞擅自出兵攻破兴元，杨复恭父子被杀死()李茂贞上表请求任他的儿子李继密暂且主持兴元军府事，唐昭宗于是调任李茂贞为山南西道节度使，任命宰相徐彦若镇守凤翔。

李茂贞不遵从诏令，上表为自己辩论说：“只是忧虑军情突变，军士难以控制。

枉自让王畿附近的百姓，因此受到损害；不知道皇上流亡，从此到哪里去？”唐昭宗因李茂贞表中的话不恭敬，不能忍受，因此向宰相杜让能询问，杜让能说：“李茂贞地大兵强，而唐的实力不能够讨伐他；凤翔又靠近京师，容易给自己造成危害而难以后悔，以后即使想诛杀晁错向诸侯谢罪，恐怕都不能够了。”唐昭宗发怒说：“我不能懦弱地坐着忍受凌辱！”于是责令杜让能整治军队，而任命覃王李嗣周为京西招讨使。

命令下达后，京师市民都知道不行，一起聚集在承天门，阻止宰相请求不要出兵，争相投掷瓦块石头打宰相，宰相下车而逃，丢失了他的印，人们心里十分恐惧，唐昭宗的主意更加坚定。

覃王率领扈驾军五十四都在盘历打仗，唐军战败溃散，李茂贞于是进犯京师，屯驻在三桥。

唐昭宗到安福门，杀掉两个枢密使向李茂贞请罪，求他罢兵。

李茂贞素来和杜让能有矛盾，于是说：“策划出兵的不是两个枢密使，而是杜让能。”在临皋驿布兵，请求杀掉杜让能。

杜让能说：“我过去说过，只有杀掉我纔能够解除国难（＼”唐昭宗流泪沾湿衣襟，贬杜让能为雷州司户参军，赐他死，李茂贞纔罢兵.第二年，河中节度使王重盈死，他的儿子王珂、王珙相争自立。

晋王李克用请求立王坷，李茂贞和韩建、王行瑜请求立王珙，唐昭宗不答应（＼李茂贞等人发怒，率领三镇军队侵犯京师，策划废掉唐昭宗，拥立吉王李保。

没有成功，而晋王也出兵，李茂贞害怕，于是杀掉宰相韦昭度、李候，留下他的养子李继鹏率兵两千在宫中值宿警卫而离去。

晋军到河中，李继鹏和王行瑜的弟弟行实等人争相劫持唐昭宗出逃，京师大乱，唐昭宗出逃住在石门。

李茂贞率兵到鄂县，杀掉李继鹏为自己赎罪。

晋军攻破王行瑜后，返回驻扎在渭北，请求攻打李茂贞。

唐昭宗认为晋相距远而李茂贞靠得近，因而想庇护他作为恩惠，希望在危急时可以依靠；而且李茂贞已杀死他的养子赎罪了，于是诏令晋军罢兵返回。

李克用叹息说：“唐不杀掉李茂贞，忧患无穷！”唐昭宗从石门返回，增募安圣、捧宸等军一万多人，任命诸王统率。

李茂贞认为唐将要讨伐自己，也整治军队请求朝见，京师百姓大为恐惧，居民都逃到山谷中。

李茂贞于是侵犯京师，唐昭宗派覃王抵御他，覃王到三桥，军队溃散，唐昭宗出逃住在华州。

派宰相孙倔率兵讨伐李茂贞，韩建为李茂贞请求，纔作罢。