子又不是骆驼，为什么要向别人下跪呢？！”蒙哥便命令把八赤蛮囚禁起来。八赤蛮对看守他的人说：“我逃窜到了海里，和鱼还有什么区别。但终于被捉住了，这是天意啊。现在海水倒流回来的时间快要到了，你们的军队应该早些回去。”蒙哥听到这话，立即班师回去，海水却已经到了，后军有的人是游水渡海回来的。蒙哥又和诸侯王拔都征伐斡罗思部，到也烈赞城，蒙哥亲自上阵搏斗，攻破了也烈赞城。

定宗三年(1248)，定宗去世，朝廷很久没有确定新的君王，朝廷内外议论纷纷，都认为蒙哥应当当皇帝，但窥伺皇位的人却很多，议而不能决。诸侯王拔都、木哥、阿里不哥、唆亦哥秃、塔察儿、大将兀良合台、速你带、帖木迭儿、也速不花都聚集在阿剌脱忽剌兀地方。拔都首先提出建议，推戴蒙哥为皇帝。当时定宗的皇后海迷失所派的使臣八剌也在座，他说“：从前太宗皇帝命令以皇孙失烈门为继承人，各位王爷和百官都听到了。现在失烈门还在，却倡议要把皇位归属于别人，那样将把失烈门放在什么位置上呢？”木哥说：“太宗有圣命，谁敢违抗他呢？但是先前议定立定宗为皇帝，是由皇后脱列忽乃和你们这些人决定的，那么，违抗太宗皇帝命令的正是你们，现在还想要指责谁呢？”八剌无话可说。兀良合台说：“蒙哥聪明有智慧，这是人人都知道的，拔都的意见非常正确。”拔都就向大家宣布这个决定，大家都同意他，立蒙哥为帝就这样决定下来了。

宪宗元年(1251)六月，西方的诸侯王别儿哥、脱哈帖木儿，东方的诸侯王也古、脱忽、亦孙哥、按只带、塔察儿、别里古带，西方的各大将班里赤等，东方的各大将也速不花等，再次在阔帖兀阿阑地方举行重大会议，共同推戴蒙哥在斡难河登上皇帝位。失烈门和他的弟弟脑忽等人心里不服气，事后有很多牢骚话。皇帝就派诸侯王旭烈和忙可撒儿率军去监视他们。诸侯王也速忙可、不里、火者等没有按时到达，皇帝便派不怜吉。。率军防备他们。于是更改了各种事务的安排：命令皇弟忽必烈管辖、治理蒙古族、汉族地区的民户；派遣塔儿、斡鲁不、察乞剌、赛典赤、赵璧等人前往燕京安抚、晓谕军民；任命忙哥撒儿为断事官；任命孛鲁合执掌发布号令、朝见皇帝、贡献礼品以及朝内朝外上奏的各项事务；任命晃兀儿留在和林看守宫阙和钱财物资，由阿蓝答儿协助他；任命牙剌瓦赤、不只儿、斡鲁不、睹答儿等掌管燕京等地行尚书省的事务，由赛典赤、匿昝马丁协助他们；任命讷怀、塔剌海、麻速忽等人掌管别失八里等地行尚书省事务，由暗都剌兀尊、阿合马、也的沙协助他们；任命阿儿浑掌管阿母河等处行尚书省事务，由法合鲁丁、匿只马丁协助他们；任命茶寒、叶了干统辖两淮等处的蒙古军、汉军，任命带答儿统辖四川等地的蒙古军、汉军，任命和里。。统辖土蕃等处的蒙古军、汉军，他们都和先前一样的征讨，进军；任命僧人海云掌管佛教方面的事务，任命道士李真常掌管道教方面的事务。叶孙脱、按只。。、畅吉、爪难、合答、曲怜、阿里出以及刚疙疸、阿散、忽都鲁等，专门骑墙居中，讨好两方，犯下引诱诸侯王作乱的罪行，全部予以处死。于是在国内颁行一些有利于国政的规定：凡属朝廷及诸侯王随意发放的牌印、诏书、圣旨、命令，全部予以收回；诸侯王乘车出行，只允许乘三匹马拉的车，远行也不能超过四匹；诸侯王不许擅自招纳民户；各下属官员不许借朝觐的名义征收、聚敛民财；百姓交纳粮食，从远处运输的，允许向其附近的官仓交纳；免除修筑和林城的一千五百名百姓的劳役。

冬，因为宴只吉带违抗命令，派合丹将他处死，并抄没他的家产。

宪宗二年春，正月，皇帝临幸失灰地方。派遣乞都不花进攻末来的吉儿都怯寨。皇太后去世。

夏季，皇帝至和林。分别把诸侯王迁徙到各个地方：合丹到别石八里地方，蔑里到叶儿的石河地方，海都到海押立地方，别儿哥到曲儿只地方，脱脱到叶密立地方，蒙哥都和太宗的皇后乞里吉忽帖尼到扩端所住的地方以西。把太宗的各位后妃的家财分别赐予各个亲王。定宗的皇后和失烈门的母亲用巫术诅咒禳灾的事情被发觉，都被赐死。贬谪失烈门、也速孛里等人到没脱赤地方。把和只、纳忽、也孙脱等人禁锢在军营。

秋季，七月，命令忽必烈征伐大理，诸侯王秃儿花、撒立征伐身毒(印度)，怯的不花征伐没里奚，旭烈征讨西域素丹等国。下诏晓谕宋朝的荆南、襄阳、樊城、均州各地守将，令他们前来归顺。