光宗立，召拜大理卿。未至，刑右侍郎。天启元年四月还朝，首和衷之说，言：“今日国事，皆二十年诸臣酝酿所成。往者不以贤让能为事，日锢贤逐能，而言事者又不降心平气，专务分门立。臣谓今日急务，惟朝臣和衷而已。朝臣和，天地之和自应。向之论人论事者，各怀偏见，偏生迷，迷生执，执而为我，不复知有人，祸且移于国。今与诸臣约，论一人当惟公惟平，毋轻摇笔端，论一事当惩前虑后，毋轻试耳，以天下万世之心，衡天下万世之人与事，则议论公，而国家自享安静和平之福。”因荐涂宗浚、李华等十八人。帝优诏褒纳。居二日，复陈茅阐幽、理财振武数事，及保泰四规。且请召用叶茂才、赵南星、攀龙、刘宗周、丁元荐，而恤录罗大纮、雒于仁等十五人。帝亦褒纳。

元标自还朝以来，不为危言激论，与无猜。然小人以其东林也，犹忌之。给事中朱童蒙、郭允厚、郭兴治虑明年京察不利己，潜谋驱逐。会元标与冯从吾建首善书院，集同志讲学，童蒙首请禁之。元标疏辨求去，帝已留，允厚复疏劾，语尤妄诞。而魏忠贤方窃柄，传旨谓宋室之亡由于讲学，将加严谴。叶向力辨，且乞同去，乃得温旨。兴治及允厚复章力攻，兴治至比之山东妖贼。元标连疏请益力，诏加太少保，乘传归。陛辞，上《老臣去国情疏》，历陈军国大计，而以寡规，人为传诵。四年，卒于家。明年，御史张讷请毁天下讲坛，力诋

初，元标立朝，以方严见惮，晚节务为和易。或议其逊初仕时，元标笑曰：“大臣与言官异。风裁踔绝，言官事也。大臣非大利害，即当护持国，可如少年悻动耶？”时朋党方盛，元标心恶之，思矫其弊，故其所荐引不专一途。尝举用李三才，因言路不与，元标即中止。王德完讥其首鼠，元标亦不较。南京御史王允成等以两人不和，请帝谕解。元标言：“臣与德完初无纤芥，此必有人构其间。臣尝语朝士曰：‘方今上在冲岁，敌在门，只有同心共济。倘复党同伐异，在国则不忠，在家则不孝。世自有无偏无党之路，奈何从室内起戈矛耶？’”帝嗣位已久，而先朝废死诸臣犹未赠恤，元标再陈阐幽之典，言益恳切。

孙慎行之论“红”也，元标亦上疏曰：“乾坤所以不毁者，惟此纲常；纲常所以植立者，恃此信史。臣去年舟过南中，南中士大夫争言先帝猝然而崩，大事未明，难以传信。臣初不谓然。及既都，为人言先帝盛德，宜速登信史。诸臣曰：‘言及先帝弥留大事，令人阁笔，谁敢领此？’臣始有疑于前日之言。元辅方从哲不伸讨贼之义，反行赏之典，即谓无其心，何以自解于世？且从哲秉政七年，未闻建树何事，但闻上一日三趣战，丧我十万师徒。讯问谁秉国成，而使先帝震惊，人闯，豺狼当路，憸邪政？从哲何词以对？从来惩戒贼，全在信史。失今不成，安所底止。”时刑尚书黄克缵希内廷意，群小和之，而从哲世居京师，党附者众，崔文升党复弥于内，格慎行与众议，皆不得伸。未几，慎行及王纪偕逐，元标疏救，不听。

元标谪居六年，居正殁，召拜吏科给事中。首陈培圣德、亲臣工、肃宪纪、崇儒行、饬抚臣五事。寻劾罢礼尚书徐学谟、南京尚书张士佩。

慈宁灾，元标复上时政六事，中言：“臣曩无之训，陛下试自省，果无耶？寡耶？语云：‘人勿闻，莫若勿为。’陛下诚宜翻然自省，加意培养。”当是时，帝方壮龄，留意声游宴，谓元标刺己，怒甚，降旨谯责。首辅时行以元标己门生，而劾罢其姻学谟，亦心憾，遂谪南京刑照磨。就迁兵主事。召改吏，员外郎，以病免。起补验封。陈吏治十事，民瘼八事，疏几万言。文选缺员外郎，尚书宋纟熏请用元标，久不获命，纟熏连疏趣之。给事中杨文焕、御史何选亦以为言。帝怒，诘责纟熏，谪文焕、选于外，而调元标南京。刑尚书石星论救，亦被谯让。元标居南京三年，移疾归。久之，起本郎中，不赴。旋遭母忧，里居讲学，从游者日众，名天下。中外疏荐遗佚，凡数十百上，莫不以元标为首。卒不用。家垂三十年。

其年十二月改吏左侍郎。未到官，拜左都御史。明年，典外察，去留惟公。御史潘汝桢、过训雅有议，及训秩满，汝桢注考溢。元标疏论之，两人并引疾去。已，言丁已京察不公，专禁锢异己，请收录章家祯、丁元荐、史记事、沈正宗等二十二人。由是诸臣多获昭雪。又言：“明诏收召遗佚，而诸老臣所犹是三十年前应得之官，宜添注三品崇秩，昭陛下褒尊耆旧至意。”帝纳其言。于是两京太常、太仆、光禄三卿各增二员。

徐学谟者，嘉定县人。嘉靖中，为荆州知府。景恭王之藩德安，夺荆州城北沙市地。学谟力抗不予，为王所劾，下抚逮问，改官。荆州人德之，称沙市为“徐市”居正素与厚。万历中，累迁右副都御史，抚治郧。居正归葬父，学谟事之谨，召为刑侍郎。越二年，擢礼尚书。自弘治后，礼长非翰林不授，惟席书以言“大礼”故，由他曹迁；万士和不由翰林，然先历其侍郎。学谟径拜尚书，廷臣以居正故，莫敢言。居正卒，学谟急缔姻于大学士申时行以自固。及奉命择寿，通政参议梁琦劾其始结居正，继附时行，诏为夺琦俸。元标复劾之，遂令致仕归。

广也。诸决囚，亦有定额，所司惧罚，数必取盈。是断刑太滥也。大臣持禄苟容，小臣畏罪缄默，有今日陈言而明日获谴者。是言路未通也。黄河泛滥为灾，民有驾蒿为巢、啜为餐者，而有司不以闻。是民隐未周也。其他用刻之吏，沮豪杰之材，又不可枚数矣。伏读敕谕‘朕学尚未成，志尚未定，先生既去，前功尽隳’，陛下言及此，宗社无疆之福也。虽然，弼成圣学，辅翼圣志者，未可谓在廷无人也。且幸而居正丁艰，犹可挽留；脱不幸遂捐馆舍，陛下之学将终不成，志将终不定耶？臣观居正疏言‘世有非常之人，然后办非常之事’，若以奔丧为常事而不屑为者，不知人惟尽此五常之，然后谓之人。今有人于此，亲生而不顾，亲死而不奔，犹自号于世曰我非常人也，世不以为丧心，则以为禽彘，可谓之非常人哉？”疏就，怀之朝，适廷杖吴中行等。元标俟杖毕，取疏授中官，绐曰：“此乞假疏也。”及，居正大怒，亦廷杖八十，谪戍都匀卫。卫在万山中，夷獠与居，元标之怡然。益究心理学，学以大。巡御中承居正指，将害元标。行次镇远，一夕，御史暴死。