回来犯，败之于桥。已而禄丰、昆陷，复率把总联甲战石鼓，大破之。乘胜攻克丽江，留土弁王天爵驻守，而自引兵规鹤庆。寇乘隙再陷丽城，耀曾军失利，退守石鼓。同治元年，再克之，迁参将。徙顿曲靖，夷卡郎寇巢，略昭通，战公山、龙，师弗胜。与护昭通镇杨盛宗往援，斩其酋所朝升，迁副将，徙守富平。八年，城陷，褫职逮问。寻以克楚雄、禄丰，贷勿治，留军自赎。十年，克澂江，复官。明年，攻迤西，连破蒙化、赵州、上下关，于是大理籓篱尽失。是冬，地轰其城，之。又明年，取大小围埂。积勋晋记名总兵，赐号达图鲁。自是与玉科定锡腊，下顺宁，破云州，擢提督。克小猛统，大吏以叛产予其残废伍，固辞弗获，乃斥家财遣之归，而以其地佐书院餐钱及宾兴费，并选开弟集廨宇，延师课读。又与李惟述克腾越。全滇平，赏黄褂，檄署永昌协。

杨玉科，字云阶，寄籍丽江。其先居湖南善化，既贵，还本籍。同治初，从和耀曾讨回。岑毓英征曲靖，识之，命领百人为前锋，积功至守备。四年，署维西协。李祖裕叛，杀把总陈聪。毓英虑生变，檄玉科代之。玉科至，刺杀祖裕，宣谕众，皆伏服，遂克丽江、鹤庆，繇是显名。

俄而杜文秀来援，拥众可二十万。玉科所止数千人，屡战弗胜。二城复陷，玉科溃围走永北。六年，从克镇雄，长驱猪供箐、海姑，与有功，叙游击。七年，西寇环偪省城，玉科绕四川会理，间袭元谋、街，规武禄，抄其后，克之，平罗次。八年，平柯渡、可郎，迁副将，赐号励勇图鲁。乘胜规嵩明，下寻甸。毓英奏令主三姚军事，连复大姚、狼邓。省城围解，擢总兵。明年，破姚州土城，被创。益开地三十馀，雷发，北城陷，遂，擒伪将金保、蓝平贵。三姚平，擢提督，易勇号瑚松额。无何，州西警，复令主大理、丽江军事，发全师速援宾、邓，遂败寇云南驿。其冬，克长邑村，规鍊铁，擒伪都督杨占鹏。于是大理北路定，权开化镇总兵。

十年，法越事起，率师关，扼观音桥，法军至，设三伏败之。闻谷松警，亟往援，而敌已乘虚，数战皆利。明年，法以重兵关，教民应于内。玉科曰：“吾百战馀生，今得死所矣！”开关搦战，中砲亡，诸军皆溃，至无人收其尸。李秉衡莅关，乃归其丧，妻氏殉焉。追赠太少保，谥武愍，予大理、镇南关建祠。毓英所多骁将，玉科外，首推李惟述。

十年，克宾川。初，永昌之陷也，玉科为伪将双元所得，见其人可用，劝归命，与订，嘱异时得志相援手，纵之归。至是约为内应，克之，署提督。攻大理小关，邑寇诈降，设座礼拜寺，约玉科往。比，心动，命移座；动如故，命再移，有间，地雷发，得不死。玉科怒，手刃四人，双元锐护之，竟复其地。

永昌自遭丧，比凋残。耀曾至，抚亡，除苛扰，革暴，教之治生，民渐复业。时乌索贼柳映苍复叛，奉檄与总兵徐联魁等会击。十三年，克之，以次削平土司诸地。光绪二年，参将苏开先诱练军譁变，据腾越。王士与合，顺、云豪悍卒乘机窃发，永昌练目李朝应之，掠施甸，迤西大扰。岑毓英以耀曾谙究边情，奏署腾越总兵。耀曾为固本计，先赴永昌，调团守隘，率师追讨，击溃李朝，馀党悉平。总督刘长佑谓其不即至，劾之，镌二级；论克顺、云功，免议，权汉中镇总兵。

惟述起锦江绅团，尝与和耀曾施方略，谋所以缀

六年，诏各省督抚举将才，毓英以耀曾应，擢授镇远镇。居镇十六年，节虚糜，赡储积，为置营田，建兵房，制械，军政大治。复以其馀设义塾，平路，劝农桑，士议谓有儒将风。二十三年，卒。民其德，请附祀毓英祠，丽江亦建祠致祭焉。

是时，滇边野夷杀英官嘉理，英公使诉于朝，朝旨趣捕急。玉科搜获而通凹、腊都等十五人，钅巢送省城伏诛。谳定，会邓川罗洪昌谋，袭州城，遂移师甲邑，克东山，擒渠率。二年，移广西右江镇。创发，乞解职，疏甫上，適苏开先陷腾越，势岌岌。玉科力疾视师，不百日悉平之，被赏赉。三年，徙广东州镇。六年，署陆路提督，坐其侄汝楫仇杀知府孔昭鈖，镌三级。寻复。

逾岁，连下漾濞、赵州，规大理。其地东临洱海，西倚苍山，自文秀窃据，内筑土垣，包伪禁城其中。玉科掘隧以攻，轰溃东南城，诸军蹈隙。寇死拒，复窖地雷破之。顿莲池，益师五千环攻城。文秀开，亲击之。败退，饮毒不即死，其党蔡廷栋舁以献，气息仅属，割其首解送省城。毓英至，廷栋佯乞款，埋地雷于行馆，迎玉科。玉科诺之，潜至伪府，据砲楼大呼，兵士争血战。毓英隐卒城外，度玉科已达，乘夜梯登。两军既合，巷战竟日，寇披卻，越数日，夺门走。克伪都，获文秀家属及廷栋等百三十人。捷，赏黄褂，予骑都尉世职。十二年，克锡腊、顺宁，移师协取云州，再予一骑都尉。全滇告宁，改一等轻车都尉。明年，觐，垂询滇池战状，视伤痕恻然。光绪改元，还署任，赐品服，晋锡二等男。