四年，张总愚犯畿辅，耕云从巡抚李鹤年军磁州，建策筑长围断贼归路。两署粮储盐法，佐治善后事，濬惠济河，河决，叙劳加布政使衔。十三年，补河陕汝。河、陕徭役重，亚于常赋，耕云立定制，严稽覈，民困稍甦。光绪三年，大旱，条上救荒七事，未及行，卒于官。

三年，迁太常寺卿，署左副都御史

及国籓师，疏言：“军兴以来，征调半天下，糜饷数千万，卒未能扫擒渠，则以屡后时而数失机也。今曾国籓蓄养锐，所向克捷。陈玉成、张洛行率悍贼数十万，齐向潜山、太湖抗拒，众寡之数，十倍于我，一有疏虞，关系甚重。此时庐、凤、六合贼势必单，请饬袁甲三、张国樑刻期捣其巢，令反顾，或令间为楚师声援，亦足褫其狂魄。”别疏劾河总督庚长，请以甲三兼摄；又论云南回匪不宜专意主抚；又陈京师本计，平粜、采买、周恤、蓄积诸事宜并举；又言钱法积弊：诸疏多见采纳。

英、法合军犯天津，耕云专疏者七，会疏者二，力主决战，上命王大臣集议。与郑亲王端华等议不合，耕云抗辩痛哭而罢。耕云初在礼，肃顺颇重之，乃是为所憎。九年，科场狱起，以科失纠下吏议，而耕云以充内监试谴独重，镌二级调用。十年，京师戒严，上将幸河，耕云代团防大臣草疏谏阻，复自以书抵肃顺，卒不听。侍郎文祥提督九门，遇耕云东城，相持哭，因为规画留守诸事。

王拯，初名锡振，字定甫，广西平人。光二十一年士，授主事，充军机章京。大学士赛尚阿视师广西，以拯从，拯时多难，慷慨思有所建白。咸丰间，自郎中累迁大理寺少卿。同治二年，降捻宋景诗由陕西还扰直隶、山东，拯奏言：“景诗冈屯砖圩，俨然嵎固，自陕逸回，其党不过数百。崇厚等一再养痈，裹胁逾万。近复于昌邑、莘、聊城、临清四州县，令村庄将所获麦与佃平分，运送冈屯，是其名为降伏，心迹转益凶悖。请密敕直隶督臣刘长佑计调来营，暴其罪而诛之。若抗违不至，直隶官军犹能越境剿。景诗既除，如杨蓬岭、程顺书等首恶，皆可骈诛，以除憝，以安畿辅。”疏，未行。其后景诗卒以叛诛。

胡林翼疏荐耕云有权略，请起用。会副都御史昶熙治河南团练，疏调从军。同治元年，率卒五千，从僧格林沁平金楼寨教匪，又偕提督张曜克张冈捻巢，以员记名，赐翎。三年，署河陕汝。西征军购粮陕州，市斛小，责属县偿其不足，凡数百万斤，耕云悉请罢之。客军有不法者，斩以徇。境多刀匪，请得节制河、陕兵，馈饷以时，兵咸用命。

军事未定，曾国籓议于广东筹饷，劳崇光创办釐金，诸弊丛起。拯疏言：“两粤为肇之区，岑溪、容县，数载皆为贼踞。信宜陈金缸尤为憝，群贼相为一气，滋蔓难图。劳崇光举办釐金，率令绅商包充垫缴，燃眉剜，事何可常？及崇光去任，徵收减少。近乃有釐务委员，或为众所殴伤，或为民间枷号，虽民情顽獷，而官吏恶劣亦可概见。以积年久之地，有负嵎圜视之贼，当一切利孔、百方搜剔之时，臣窃恐利未十而害已百。万一两粤复糜烂，更不知何所措手足，岂惟釐金不能办而已？”因荐广东员唐启廕、两淮运使郭嵩焘、浙江运使成孙诒。旋用嵩焘督广东釐金，自拯疏发之也。

则巧为弥，掩一人耳目；外则恣其朘削，竭万姓脂膏。惟恳俯念籓篱重地，立予罢斥，简大员往代。于洪湖多募师，兼饬傅振全军移驻固镇、灵，冀收皖北，以固山东。”及庐州失守，又疏言：“昔人建省安庆，与九江、江宁为犄角，控扼长江。上年徙治庐州，已失形胜，兹并庐州亦不能守。胡林翼等自武汉九江，而安徽之贼，或自英、霍走湖北，牵我上游，或自徽、歙扰浙西，窥我腹地。我军分救援，罢于奔命。贼有四达之路，我无三面之围，虽日克一城，何益？抚臣福济屡挫损威，候补京堂袁甲三素得民心，如以为巡抚，必奋图报。”

耕云在言路著直声，任监司，巡抚张之万、李鹤年皆倚重之，军事多所赞画。卒后，巡抚李庆翱以灾荒被劾，牵及冒领兵饷事，辞连耕云，后终得白云。