也有人说，珍妃是慈禧偷偷的命人丢到井中的，光绪当时并不知这件事情。

金井一叶坠，凄凉瑶殿芳，残枝未零落，映日有辉光。沟空恨，霓裳枉断；何如泽畔草，犹得宿鸳鸯。

慈禧听了这话，气得脸发青，霎时间从甲午到戊戌的一肚怨气涌上心。戊戌政变后，她想废光绪帝，却引来外国人的横加涉没有废成。这次八国联军更是明目张胆地要自己让权给光绪，岂能把光绪帝单独留在京城，要死要走都一定要把光绪带在边。慈禧听珍贵妃这么说，杀机立起，厉声说：“把她扔到井中去！”光绪帝哀痛至极，跪地求情，慈禧更怒。太监二总崔玉桂走到珍妃的边，说：“请主儿遵旨吧！”珍贵妃就此香消玉陨。

慈禧太后天天在颐和园中，想尽各样玩乐，皇后妃嫔及公主福晋们经常前往园中向慈禧请安，陪伴慈禧，惟独难得看到珍贵妃在颐和园中现。珍贵妃天天在皇和光绪呆在一起，全心地投参与国家大政的兴革废举。

传说辛丑回銮后，慈禧曾打发人从井中把珍妃捞起来，尸首颜如生，胭脂尚存，只是失去了扎的一飘带。

后政权后必须要有个颐养天年的地方，准备皇帝大婚的事远不及安排慈禧颐养的地方来得重要，当时又恰好临近慈禧的七十大寿了，在醇亲王的主持下，不惜移用海军经费来修“颐和园”在万寿山的上建佛香阁，俯临排云殿，松槐夹峙的千步廊。园中再建一人工湖，湖上有独特的十七孔桥，湖边有石舫，湖中还有洪钩状元国带回来的两艘小火供慈禧游玩。本来园中还有一辆欧州人送的汽车，但慈禧坐了第一回后就打了冷，因为慈禧坐车的时候，她发现司机居然坐在她的前面，这是她无法忍受的，在她潜意识中，她要么坐在最前面，要么就是在上。

可怜傻不啦叽的珍贵妃居然还说：“不如请老佛爷暂时离开京城，让我与皇上留下来与洋人办涉，事情总会有转圜的余地！”

康有为的“公车上书”终于激起了光绪皇帝乾纲独断的悲愤壮志。珍贵妃尊敬的老师文廷式和康有为一起组织了学会，珍贵妃全心地投到维新变法的活动中，在珍贵妃的影响下，光绪帝更定了他维新变革的决心，光绪帝在一八九七年第一次召见了康有为，康有为对光绪说：“瓜分豆剖，几可忧危；揭竿斩木，渐机芽。”光绪表示不甘作亡国之君。这一切都有人随时向颐和园中的慈禧报告，慈禧脸一天天地难看起来，她暂时还不能把光绪帝怎样，就把一腔怒火集中在珍贵妃的上。珍贵妃喜摄影，她曾和光绪互换衣履，拍成各姿式的照片，她曾经僭越制乘坐八人肩舆，这一切都成了珍贵妃的罪状。这天慈禧怒气冲冲地回到皇，把所有妃嫔一齐召来，把光绪也叫到跟前，将珍贵妃鞭答拷掠，慈禧甚至自己上前狠狠地打了珍贵妃两个耳光。光绪帝战-地跪地求情，珍贵妃把泪默默地吞嘴里。此后珍妃一再被贬降，杖责，禁锢。一八九八年九月二十一日，由于袁世凯的告密，慈禧勾结荣禄发动戊戌政变，将光绪帝囚禁在瀛台，宣布自己“亲政”珍贵妃被关在北三所。

后来追悼珍妃的诗词不断现，恽毓是这样写：

光绪二十六年夏天，八国联军侵华，扬言要慈禧太后政权。在八国联军近京城的时候，慈禧太后准备逃，她把后妃都召集到宁寿，假惺惺地哭着说：“谁料到今天怎么到这样的地步，洋人京，你们必遭毒手，为了保住清白，我们娘儿们只有井了。”说完盯着珍妃，叫她：“你先下去！”

光绪皇帝成婚后，特别喜珍贵妃，而温婉可人，善解人意的珍贵妃也颇得慈禧太后的心，慈禧经常要她帮自己批阅奏章，而珍贵妃为慈禧预测批答，也百无一失，慈禧听说珍贵妃的一手字写得很好，慈禧便常要她写一些福、禄、寿、喜的擘窠大字，作为慈禧赏赐大臣的礼，珍贵妃心思乖巧，便模仿慈禧的笔意，更讨得慈禧的心，珍贵妃喜丹青，慈禧还特地叫中的供奉缪素筠教她画卉。这样大概过了一年，慈禧终于依依不舍地宣布结束垂帘听政，住到了颐和园。

不怎样，你到北京故游览，还可见到珍妃井，那井中已没有一滴。珍妃的墓先是葬在西直门外，光绪死后，把她移葬崇陵，死后她和光绪天天守在一起。慈禧的墓后来被军阀盗掘，抛骨荒野，应该不会再去迫害珍妃了。

那时光绪皇帝虽然亲政，一切国家大事还是要秉承慈禧的意旨理，虽然颇想振衰起蔽，有一番轰轰烈烈的作为，无奈内外扔受制于慈德，光绪仍然是一个傀儡，以光绪为首的帝党与以慈禧为首的后党斗争日益激烈。甲午之战，李鸿章渗淡经营十六年，原以为可以大展雄图的北洋舰队，居然不堪一击，向日本人以割地赔款引起全国有识之士的痛恨，对握有实权的慈禧更是恨之骨。当时正逢慈禧七十大寿，南洋大臣，湖广总督在任所为她祝寿，席上辜游铭大唱“桶歌”