前北洋水师各舰不适合远洋深海作战，对日本本土的安全不是很大。但王辰浩的舰队具备远洋作战能力，日本海军目前的实力不足以跟他抗衡，日本海防将受到严重威胁。

日本新任海军大臣是山本权兵卫，历史上的此人为日本建立近代海军打下了基础，因此被誉为日本“海军之父”日本政府在1892年第四届议会上削减了预算案，开始行政改革。当时山本权兵卫位居海军省官房主事，在他主导下成立了相对独立于海军省（本部）的海军军令部（参谋机构），使落后于6军的海军有了和6军平等的地位。在同时进行的人员调过程中，他把同乡、前辈以及在明治维新中立过功的人也列为调整对象，对有用的人材则毫无偏见地录用。象斋藤实、冈田启介、山下源太郎等日后成为重要角色的人物都是在那时由山本权兵卫提拔起来的。他的政治手法得到山县有朋和井上馨的赏识。在山本权兵卫还当局长的时候，周围的人就称他为“权兵卫大臣”

山本权兵卫在由萨摩派阀掌握主导权的海军中比同是萨摩藩出身的黑田清隆、西乡从道等人年轻1o多岁，属于第二代领袖。由于他有着被称为“权兵卫大臣”的实力背景，所以从1896年5月开始担任内阁的海军大臣，成为海军的中心人物。

此时，日本海军只剩下西海舰队的部分近海防御战舰，海军力量积极微弱。受限于经费，山本权兵卫努力劝说黑田清隆，最终保住了在英国建造的两艘富士级战列舰没有流产。同时，山本权兵卫耗费12万日元雇佣丹麦打捞队将自沉在黄海的狼号打捞出来，经过一年半的处理使其重新服役，成为日本海军的旗舰。另外他又花费巨资将沉没在仁川港内的联合舰队各舰进行了一番打捞作业。由于这些战舰被毁坏严重，最终打捞出水后只拆除了一些值钱的火炮和蒸汽机等设备，剩下的全部以废铁价格出售。

为了重建日本海军，山本权兵卫积极向各国列强游说借款。由于德法俄三国令日本政府和国民不愉快，不能跟他们借款。而英国那边欠了一屁股债还不清，对方也不敢再借钱给日本。最终山本权兵卫跟美国人取得了联系，并承诺愿意在日本移民问题上，以及在夏威夷问题上做出让步，以此来寻求美国政府的经济援助。

山本权兵卫一方面大肆鼓吹清帝国海军的威胁，另一方面将美国人的意思拿到会议上讨论，以此来获得内阁对海军的拨款，尽快回复日本海军元气。

山本权兵卫的提议令黑田清隆内阁陷入困境，眼下日本经济用屋漏偏逢连夜雨来形容了，黑田清隆知道重建海军的重要性，也知道美国人有的是钱，若肯援助日本将极大的减轻政府压力。但是长期以来日本在移民问题上和夏威夷问题上一直不肯让步，国内民众对于美国人第一个撬开日本国门，逼迫日本签署第一个不平等条约的愤怒依然没有平息，这个时候对美国让步不知道国民会有什么想法。一个处理不好就将面临倒台危险。